Havndrup este un sat din comuna Faaborg-Midtfyn, din regiunea Syddanmark, Danemarca. Havndrup se află la 53 m altitudine. Cel mai apropiat oraș mare este Odense, la 16,2 km la nord-vest. Printre obiectivele din împrejurimi: Egeskov Castle (13,8 km), Nonnebakken (15,8 km) și Viking Age Ring Fortresses (15,8 km). Printre locurile naturale: Tornø (19,2 km) și Frederiksø (26 km).