Pabarupis este un sat din municipalitatea districtuală Jonava, din județul Kaunas, Lituania. Pabarupis se află la 63 m altitudine. Cel mai apropiat oraș mare este Jonava, la 15,5 km la sud-est. Printre obiectivele din împrejurimi: Ninth Fort (29 km), Muzeul Național de Artă M. K. Čiurlionis (32 km) și castelul Kaunas (33 km).