Markūnai este un sat din municipalitatea districtuală Trakai, din județul Vilnius, Lituania. Markūnai se află la 157 m altitudine. Cel mai apropiat oraș mare este Vilnius, la 37 km la est. Printre obiectivele din împrejurimi: Trakai Island Castle (18,0 km), Vilnius Cathedral (37 km) și Basilica of the Visitation of the Blessed Virgin Mary (17,1 km).
Se scrie și Markūnai.